Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXJ3

Brip1, Fanconi anemia group J protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brip1Q5SXJ3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms