Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tsr1Q5SWD9 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tsr1Q5SWD9 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tsr1Q5SWD9 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tsr1Q5SWD9 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tsr1Q5SWD9 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tsr1Q5SWD9 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tsr1Q5SWD9 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tsr1Q5SWD9 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tsr1Q5SWD9 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms