Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Psme4Q5SSW2 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Psme4Q5SSW2 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Psme4Q5SSW2 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psme4Q5SSW2 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psme4Q5SSW2 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psme4Q5SSW2 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psme4Q5SSW2 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psme4Q5SSW2 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psme4Q5SSW2 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psme4Q5SSW2 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psme4Q5SSW2 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psme4Q5SSW2 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Psme4Q5SSW2 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psme4Q5SSW2 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psme4Q5SSW2 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psme4Q5SSW2 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Psme4Q5SSW2 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psme4Q5SSW2 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psme4Q5SSW2 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psme4Q5SSW2 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psme4Q5SSW2 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psme4Q5SSW2 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psme4Q5SSW2 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psme4Q5SSW2 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psme4Q5SSW2 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psme4Q5SSW2 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psme4Q5SSW2 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psme4Q5SSW2 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Psme4Q5SSW2 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psme4Q5SSW2 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psme4Q5SSW2 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psme4Q5SSW2 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psme4Q5SSW2 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psme4Q5SSW2 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psme4Q5SSW2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psme4Q5SSW2 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psme4Q5SSW2 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psme4Q5SSW2 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psme4Q5SSW2 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psme4Q5SSW2 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psme4Q5SSW2 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psme4Q5SSW2 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psme4Q5SSW2 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psme4Q5SSW2 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psme4Q5SSW2 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Psme4Q5SSW2 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psme4Q5SSW2 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Psme4Q5SSW2 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psme4Q5SSW2 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psme4Q5SSW2 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psme4Q5SSW2 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psme4Q5SSW2 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psme4Q5SSW2 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Psme4Q5SSW2 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psme4Q5SSW2 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psme4Q5SSW2 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psme4Q5SSW2 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psme4Q5SSW2 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psme4Q5SSW2 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Psme4Q5SSW2 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Psme4Q5SSW2 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Psme4Q5SSW2 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psme4Q5SSW2 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psme4Q5SSW2 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psme4Q5SSW2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psme4Q5SSW2 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psme4Q5SSW2 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psme4Q5SSW2 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psme4Q5SSW2 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psme4Q5SSW2 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Psme4Q5SSW2 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Psme4Q5SSW2 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Psme4Q5SSW2 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Psme4Q5SSW2 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psme4Q5SSW2 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psme4Q5SSW2 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psme4Q5SSW2 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psme4Q5SSW2 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psme4Q5SSW2 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psme4Q5SSW2 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psme4Q5SSW2 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psme4Q5SSW2 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psme4Q5SSW2 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psme4Q5SSW2 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psme4Q5SSW2 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psme4Q5SSW2 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psme4Q5SSW2 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psme4Q5SSW2 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psme4Q5SSW2 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psme4Q5SSW2 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Psme4Q5SSW2 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Psme4Q5SSW2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Psme4Q5SSW2 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Psme4Q5SSW2 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Psme4Q5SSW2 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Psme4Q5SSW2 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Psme4Q5SSW2 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Psme4Q5SSW2 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Psme4Q5SSW2 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms