Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJI4

Pkdcc, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PkdccQ5RJI4 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PkdccQ5RJI4 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PkdccQ5RJI4 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PkdccQ5RJI4 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PkdccQ5RJI4 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PkdccQ5RJI4 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PkdccQ5RJI4 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PkdccQ5RJI4 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PkdccQ5RJI4 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PkdccQ5RJI4 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PkdccQ5RJI4 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PkdccQ5RJI4 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PkdccQ5RJI4 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PkdccQ5RJI4 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PkdccQ5RJI4 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PkdccQ5RJI4 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PkdccQ5RJI4 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PkdccQ5RJI4 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PkdccQ5RJI4 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PkdccQ5RJI4 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PkdccQ5RJI4 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PkdccQ5RJI4 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PkdccQ5RJI4 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PkdccQ5RJI4 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PkdccQ5RJI4 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PkdccQ5RJI4 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PkdccQ5RJI4 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PkdccQ5RJI4 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PkdccQ5RJI4 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PkdccQ5RJI4 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PkdccQ5RJI4 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PkdccQ5RJI4 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PkdccQ5RJI4 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PkdccQ5RJI4 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PkdccQ5RJI4 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PkdccQ5RJI4 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PkdccQ5RJI4 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PkdccQ5RJI4 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PkdccQ5RJI4 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PkdccQ5RJI4 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PkdccQ5RJI4 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PkdccQ5RJI4 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PkdccQ5RJI4 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PkdccQ5RJI4 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PkdccQ5RJI4 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PkdccQ5RJI4 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PkdccQ5RJI4 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PkdccQ5RJI4 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PkdccQ5RJI4 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PkdccQ5RJI4 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PkdccQ5RJI4 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PkdccQ5RJI4 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PkdccQ5RJI4 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PkdccQ5RJI4 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PkdccQ5RJI4 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PkdccQ5RJI4 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PkdccQ5RJI4 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PkdccQ5RJI4 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PkdccQ5RJI4 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PkdccQ5RJI4 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PkdccQ5RJI4 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PkdccQ5RJI4 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PkdccQ5RJI4 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PkdccQ5RJI4 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PkdccQ5RJI4 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PkdccQ5RJI4 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PkdccQ5RJI4 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PkdccQ5RJI4 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PkdccQ5RJI4 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PkdccQ5RJI4 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PkdccQ5RJI4 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PkdccQ5RJI4 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PkdccQ5RJI4 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PkdccQ5RJI4 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PkdccQ5RJI4 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PkdccQ5RJI4 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PkdccQ5RJI4 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PkdccQ5RJI4 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PkdccQ5RJI4 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PkdccQ5RJI4 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PkdccQ5RJI4 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PkdccQ5RJI4 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PkdccQ5RJI4 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PkdccQ5RJI4 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PkdccQ5RJI4 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PkdccQ5RJI4 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PkdccQ5RJI4 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PkdccQ5RJI4 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PkdccQ5RJI4 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PkdccQ5RJI4 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PkdccQ5RJI4 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PkdccQ5RJI4 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PkdccQ5RJI4 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PkdccQ5RJI4 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PkdccQ5RJI4 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PkdccQ5RJI4 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PkdccQ5RJI4 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PkdccQ5RJI4 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PkdccQ5RJI4 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PkdccQ5RJI4 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms