Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Trim41Q5NCC3 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Trim41Q5NCC3 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Trim41Q5NCC3 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Trim41Q5NCC3 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Trim41Q5NCC3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Trim41Q5NCC3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Trim41Q5NCC3 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Trim41Q5NCC3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Trim41Q5NCC3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Trim41Q5NCC3 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Trim41Q5NCC3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Trim41Q5NCC3 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Trim41Q5NCC3 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Trim41Q5NCC3 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Trim41Q5NCC3 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Trim41Q5NCC3 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Trim41Q5NCC3 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Trim41Q5NCC3 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Trim41Q5NCC3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Trim41Q5NCC3 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Trim41Q5NCC3 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
Trim41Q5NCC3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Trim41Q5NCC3 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Trim41Q5NCC3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Trim41Q5NCC3 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Trim41Q5NCC3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Trim41Q5NCC3 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Trim41Q5NCC3 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Trim41Q5NCC3 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Trim41Q5NCC3 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Trim41Q5NCC3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Trim41Q5NCC3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Trim41Q5NCC3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Trim41Q5NCC3 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Trim41Q5NCC3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Trim41Q5NCC3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Trim41Q5NCC3 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Trim41Q5NCC3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Trim41Q5NCC3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Trim41Q5NCC3 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Trim41Q5NCC3 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Trim41Q5NCC3 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Trim41Q5NCC3 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Trim41Q5NCC3 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Trim41Q5NCC3 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Trim41Q5NCC3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Trim41Q5NCC3 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Trim41Q5NCC3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Trim41Q5NCC3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Trim41Q5NCC3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Trim41Q5NCC3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Trim41Q5NCC3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Trim41Q5NCC3 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Trim41Q5NCC3 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Trim41Q5NCC3 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Trim41Q5NCC3 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Trim41Q5NCC3 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Trim41Q5NCC3 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Trim41Q5NCC3 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Trim41Q5NCC3 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Trim41Q5NCC3 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Trim41Q5NCC3 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Trim41Q5NCC3 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Trim41Q5NCC3 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Trim41Q5NCC3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Trim41Q5NCC3 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Trim41Q5NCC3 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Trim41Q5NCC3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Trim41Q5NCC3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Trim41Q5NCC3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Trim41Q5NCC3 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Trim41Q5NCC3 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Trim41Q5NCC3 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Trim41Q5NCC3 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Trim41Q5NCC3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Trim41Q5NCC3 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Trim41Q5NCC3 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Trim41Q5NCC3 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Trim41Q5NCC3 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Trim41Q5NCC3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Trim41Q5NCC3 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Trim41Q5NCC3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Trim41Q5NCC3 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Trim41Q5NCC3 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Trim41Q5NCC3 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Trim41Q5NCC3 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Trim41Q5NCC3 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Trim41Q5NCC3 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Trim41Q5NCC3 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Trim41Q5NCC3 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Trim41Q5NCC3 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Trim41Q5NCC3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Trim41Q5NCC3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Trim41Q5NCC3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Trim41Q5NCC3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Trim41Q5NCC3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Trim41Q5NCC3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Trim41Q5NCC3 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Trim41Q5NCC3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms