Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC05

Ttf2, Transcription termination factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf2Q5NC05 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms