Protein–RNA interactions for Protein: Q571B6

Whamm, WASP homolog-associated protein with actin, membranes and microtubules, mousemouse

Predictions only

Length 793 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WhammQ571B6 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
WhammQ571B6 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
WhammQ571B6 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
WhammQ571B6 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
WhammQ571B6 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
WhammQ571B6 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
WhammQ571B6 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
WhammQ571B6 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
WhammQ571B6 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
WhammQ571B6 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
WhammQ571B6 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
WhammQ571B6 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
WhammQ571B6 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
WhammQ571B6 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
WhammQ571B6 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
WhammQ571B6 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
WhammQ571B6 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.02■□□□□ -0
WhammQ571B6 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
WhammQ571B6 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
WhammQ571B6 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
WhammQ571B6 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.02■□□□□ -0
WhammQ571B6 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.02■□□□□ -0
WhammQ571B6 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
WhammQ571B6 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
WhammQ571B6 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
WhammQ571B6 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
WhammQ571B6 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
WhammQ571B6 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
WhammQ571B6 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
WhammQ571B6 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
WhammQ571B6 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
WhammQ571B6 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
WhammQ571B6 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
WhammQ571B6 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
WhammQ571B6 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
WhammQ571B6 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
WhammQ571B6 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
WhammQ571B6 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
WhammQ571B6 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
WhammQ571B6 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
WhammQ571B6 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
WhammQ571B6 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
WhammQ571B6 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
WhammQ571B6 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
WhammQ571B6 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
WhammQ571B6 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
WhammQ571B6 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
WhammQ571B6 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
WhammQ571B6 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
WhammQ571B6 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
WhammQ571B6 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
WhammQ571B6 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
WhammQ571B6 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
WhammQ571B6 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
WhammQ571B6 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
WhammQ571B6 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
WhammQ571B6 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
WhammQ571B6 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
WhammQ571B6 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
WhammQ571B6 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
WhammQ571B6 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
WhammQ571B6 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
WhammQ571B6 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
WhammQ571B6 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
WhammQ571B6 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
WhammQ571B6 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
WhammQ571B6 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
WhammQ571B6 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
WhammQ571B6 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
WhammQ571B6 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
WhammQ571B6 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
WhammQ571B6 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
WhammQ571B6 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
WhammQ571B6 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
WhammQ571B6 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
WhammQ571B6 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
WhammQ571B6 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
WhammQ571B6 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
WhammQ571B6 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
WhammQ571B6 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
WhammQ571B6 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
WhammQ571B6 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
WhammQ571B6 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
WhammQ571B6 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
WhammQ571B6 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
WhammQ571B6 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
WhammQ571B6 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
WhammQ571B6 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15□□□□□ -0.01
WhammQ571B6 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15□□□□□ -0.01
WhammQ571B6 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15□□□□□ -0.01
WhammQ571B6 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
WhammQ571B6 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
WhammQ571B6 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
WhammQ571B6 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
WhammQ571B6 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
WhammQ571B6 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
WhammQ571B6 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
WhammQ571B6 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
WhammQ571B6 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
WhammQ571B6 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms