Protein–RNA interactions for Protein: Q569L8

Cenpj, Centromere protein J, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpjQ569L8 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CenpjQ569L8 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CenpjQ569L8 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CenpjQ569L8 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CenpjQ569L8 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CenpjQ569L8 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CenpjQ569L8 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CenpjQ569L8 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CenpjQ569L8 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CenpjQ569L8 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CenpjQ569L8 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CenpjQ569L8 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CenpjQ569L8 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CenpjQ569L8 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CenpjQ569L8 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CenpjQ569L8 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CenpjQ569L8 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CenpjQ569L8 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CenpjQ569L8 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CenpjQ569L8 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CenpjQ569L8 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CenpjQ569L8 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CenpjQ569L8 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CenpjQ569L8 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CenpjQ569L8 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CenpjQ569L8 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CenpjQ569L8 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CenpjQ569L8 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CenpjQ569L8 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CenpjQ569L8 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CenpjQ569L8 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CenpjQ569L8 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CenpjQ569L8 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CenpjQ569L8 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CenpjQ569L8 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CenpjQ569L8 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CenpjQ569L8 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CenpjQ569L8 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CenpjQ569L8 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CenpjQ569L8 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CenpjQ569L8 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CenpjQ569L8 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CenpjQ569L8 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CenpjQ569L8 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CenpjQ569L8 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CenpjQ569L8 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CenpjQ569L8 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CenpjQ569L8 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CenpjQ569L8 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CenpjQ569L8 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CenpjQ569L8 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CenpjQ569L8 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CenpjQ569L8 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CenpjQ569L8 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CenpjQ569L8 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CenpjQ569L8 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CenpjQ569L8 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CenpjQ569L8 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CenpjQ569L8 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CenpjQ569L8 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CenpjQ569L8 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CenpjQ569L8 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CenpjQ569L8 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CenpjQ569L8 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CenpjQ569L8 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CenpjQ569L8 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CenpjQ569L8 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CenpjQ569L8 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CenpjQ569L8 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CenpjQ569L8 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CenpjQ569L8 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CenpjQ569L8 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CenpjQ569L8 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CenpjQ569L8 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CenpjQ569L8 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CenpjQ569L8 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CenpjQ569L8 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CenpjQ569L8 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CenpjQ569L8 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CenpjQ569L8 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CenpjQ569L8 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CenpjQ569L8 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CenpjQ569L8 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CenpjQ569L8 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CenpjQ569L8 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CenpjQ569L8 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CenpjQ569L8 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CenpjQ569L8 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CenpjQ569L8 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CenpjQ569L8 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CenpjQ569L8 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CenpjQ569L8 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CenpjQ569L8 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
CenpjQ569L8 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CenpjQ569L8 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CenpjQ569L8 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CenpjQ569L8 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CenpjQ569L8 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CenpjQ569L8 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CenpjQ569L8 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms