Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR2

Lrig2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig2Q52KR2 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Lrig2Q52KR2 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Lrig2Q52KR2 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Lrig2Q52KR2 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Lrig2Q52KR2 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Lrig2Q52KR2 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms