Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

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Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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