Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms