Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H1

Ckap2, Cytoskeleton-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2Q3V1H1 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ckap2Q3V1H1 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ckap2Q3V1H1 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ckap2Q3V1H1 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ckap2Q3V1H1 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ckap2Q3V1H1 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ckap2Q3V1H1 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ckap2Q3V1H1 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ckap2Q3V1H1 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ckap2Q3V1H1 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ckap2Q3V1H1 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ckap2Q3V1H1 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ckap2Q3V1H1 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ckap2Q3V1H1 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ckap2Q3V1H1 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ckap2Q3V1H1 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ckap2Q3V1H1 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ckap2Q3V1H1 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ckap2Q3V1H1 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ckap2Q3V1H1 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ckap2Q3V1H1 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ckap2Q3V1H1 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ckap2Q3V1H1 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ckap2Q3V1H1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ckap2Q3V1H1 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ckap2Q3V1H1 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ckap2Q3V1H1 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ckap2Q3V1H1 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ckap2Q3V1H1 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ckap2Q3V1H1 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ckap2Q3V1H1 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ckap2Q3V1H1 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ckap2Q3V1H1 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ckap2Q3V1H1 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ckap2Q3V1H1 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ckap2Q3V1H1 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ckap2Q3V1H1 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ckap2Q3V1H1 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ckap2Q3V1H1 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ckap2Q3V1H1 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ckap2Q3V1H1 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ckap2Q3V1H1 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ckap2Q3V1H1 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ckap2Q3V1H1 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ckap2Q3V1H1 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ckap2Q3V1H1 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ckap2Q3V1H1 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ckap2Q3V1H1 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ckap2Q3V1H1 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ckap2Q3V1H1 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ckap2Q3V1H1 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ckap2Q3V1H1 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ckap2Q3V1H1 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ckap2Q3V1H1 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ckap2Q3V1H1 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ckap2Q3V1H1 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ckap2Q3V1H1 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ckap2Q3V1H1 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ckap2Q3V1H1 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ckap2Q3V1H1 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ckap2Q3V1H1 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ckap2Q3V1H1 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ckap2Q3V1H1 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ckap2Q3V1H1 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ckap2Q3V1H1 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ckap2Q3V1H1 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ckap2Q3V1H1 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ckap2Q3V1H1 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ckap2Q3V1H1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ckap2Q3V1H1 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ckap2Q3V1H1 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ckap2Q3V1H1 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ckap2Q3V1H1 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ckap2Q3V1H1 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ckap2Q3V1H1 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ckap2Q3V1H1 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ckap2Q3V1H1 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ckap2Q3V1H1 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ckap2Q3V1H1 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ckap2Q3V1H1 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ckap2Q3V1H1 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ckap2Q3V1H1 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ckap2Q3V1H1 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ckap2Q3V1H1 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ckap2Q3V1H1 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ckap2Q3V1H1 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ckap2Q3V1H1 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ckap2Q3V1H1 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ckap2Q3V1H1 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ckap2Q3V1H1 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ckap2Q3V1H1 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ckap2Q3V1H1 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ckap2Q3V1H1 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ckap2Q3V1H1 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ckap2Q3V1H1 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ckap2Q3V1H1 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ckap2Q3V1H1 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ckap2Q3V1H1 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ckap2Q3V1H1 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ckap2Q3V1H1 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms