Protein–RNA interactions for Protein: Q3V009

Tmed1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed1Q3V009 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmed1Q3V009 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmed1Q3V009 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmed1Q3V009 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmed1Q3V009 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmed1Q3V009 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmed1Q3V009 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmed1Q3V009 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmed1Q3V009 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmed1Q3V009 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmed1Q3V009 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmed1Q3V009 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmed1Q3V009 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmed1Q3V009 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmed1Q3V009 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmed1Q3V009 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmed1Q3V009 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmed1Q3V009 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmed1Q3V009 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmed1Q3V009 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmed1Q3V009 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmed1Q3V009 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmed1Q3V009 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmed1Q3V009 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmed1Q3V009 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmed1Q3V009 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmed1Q3V009 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmed1Q3V009 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmed1Q3V009 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmed1Q3V009 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmed1Q3V009 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmed1Q3V009 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmed1Q3V009 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmed1Q3V009 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmed1Q3V009 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmed1Q3V009 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmed1Q3V009 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmed1Q3V009 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmed1Q3V009 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmed1Q3V009 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmed1Q3V009 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmed1Q3V009 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmed1Q3V009 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmed1Q3V009 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmed1Q3V009 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmed1Q3V009 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmed1Q3V009 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmed1Q3V009 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmed1Q3V009 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmed1Q3V009 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmed1Q3V009 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmed1Q3V009 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmed1Q3V009 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmed1Q3V009 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmed1Q3V009 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmed1Q3V009 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmed1Q3V009 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmed1Q3V009 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmed1Q3V009 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmed1Q3V009 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmed1Q3V009 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmed1Q3V009 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmed1Q3V009 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmed1Q3V009 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmed1Q3V009 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmed1Q3V009 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmed1Q3V009 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmed1Q3V009 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmed1Q3V009 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmed1Q3V009 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmed1Q3V009 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmed1Q3V009 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmed1Q3V009 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmed1Q3V009 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmed1Q3V009 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmed1Q3V009 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmed1Q3V009 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmed1Q3V009 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmed1Q3V009 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmed1Q3V009 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmed1Q3V009 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmed1Q3V009 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmed1Q3V009 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmed1Q3V009 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmed1Q3V009 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmed1Q3V009 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmed1Q3V009 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmed1Q3V009 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmed1Q3V009 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmed1Q3V009 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmed1Q3V009 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmed1Q3V009 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmed1Q3V009 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmed1Q3V009 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmed1Q3V009 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmed1Q3V009 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmed1Q3V009 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmed1Q3V009 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmed1Q3V009 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmed1Q3V009 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms