Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW77

Gm12888, MCG59630, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm12888Q3UW77 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm12888Q3UW77 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm12888Q3UW77 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm12888Q3UW77 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm12888Q3UW77 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm12888Q3UW77 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm12888Q3UW77 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm12888Q3UW77 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm12888Q3UW77 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm12888Q3UW77 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm12888Q3UW77 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm12888Q3UW77 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm12888Q3UW77 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm12888Q3UW77 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm12888Q3UW77 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm12888Q3UW77 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm12888Q3UW77 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm12888Q3UW77 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm12888Q3UW77 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm12888Q3UW77 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm12888Q3UW77 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm12888Q3UW77 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm12888Q3UW77 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm12888Q3UW77 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm12888Q3UW77 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm12888Q3UW77 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm12888Q3UW77 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm12888Q3UW77 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm12888Q3UW77 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm12888Q3UW77 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm12888Q3UW77 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm12888Q3UW77 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm12888Q3UW77 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm12888Q3UW77 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm12888Q3UW77 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm12888Q3UW77 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm12888Q3UW77 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm12888Q3UW77 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm12888Q3UW77 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm12888Q3UW77 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm12888Q3UW77 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm12888Q3UW77 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm12888Q3UW77 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm12888Q3UW77 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm12888Q3UW77 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm12888Q3UW77 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm12888Q3UW77 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm12888Q3UW77 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm12888Q3UW77 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm12888Q3UW77 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm12888Q3UW77 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm12888Q3UW77 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm12888Q3UW77 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm12888Q3UW77 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm12888Q3UW77 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm12888Q3UW77 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm12888Q3UW77 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm12888Q3UW77 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm12888Q3UW77 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm12888Q3UW77 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm12888Q3UW77 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm12888Q3UW77 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm12888Q3UW77 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm12888Q3UW77 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm12888Q3UW77 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm12888Q3UW77 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm12888Q3UW77 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm12888Q3UW77 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm12888Q3UW77 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm12888Q3UW77 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm12888Q3UW77 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm12888Q3UW77 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm12888Q3UW77 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm12888Q3UW77 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm12888Q3UW77 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm12888Q3UW77 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm12888Q3UW77 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm12888Q3UW77 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm12888Q3UW77 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm12888Q3UW77 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm12888Q3UW77 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm12888Q3UW77 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm12888Q3UW77 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm12888Q3UW77 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm12888Q3UW77 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm12888Q3UW77 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm12888Q3UW77 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm12888Q3UW77 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm12888Q3UW77 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm12888Q3UW77 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm12888Q3UW77 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm12888Q3UW77 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm12888Q3UW77 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm12888Q3UW77 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm12888Q3UW77 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm12888Q3UW77 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm12888Q3UW77 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm12888Q3UW77 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm12888Q3UW77 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm12888Q3UW77 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms