Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW22

Defb48, Beta-defensin 42, mousemouse

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb48Q3UW22 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defb48Q3UW22 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defb48Q3UW22 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defb48Q3UW22 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defb48Q3UW22 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defb48Q3UW22 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defb48Q3UW22 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defb48Q3UW22 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defb48Q3UW22 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms