Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP24

Nlrc4, NLR family CARD domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc4Q3UP24 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms