Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKJ7

Smu1, WD40 repeat-containing protein SMU1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smu1Q3UKJ7 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Smu1Q3UKJ7 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smu1Q3UKJ7 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smu1Q3UKJ7 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Smu1Q3UKJ7 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Smu1Q3UKJ7 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smu1Q3UKJ7 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smu1Q3UKJ7 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smu1Q3UKJ7 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smu1Q3UKJ7 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Smu1Q3UKJ7 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smu1Q3UKJ7 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smu1Q3UKJ7 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smu1Q3UKJ7 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smu1Q3UKJ7 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smu1Q3UKJ7 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smu1Q3UKJ7 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smu1Q3UKJ7 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smu1Q3UKJ7 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smu1Q3UKJ7 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smu1Q3UKJ7 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smu1Q3UKJ7 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smu1Q3UKJ7 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smu1Q3UKJ7 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smu1Q3UKJ7 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smu1Q3UKJ7 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smu1Q3UKJ7 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smu1Q3UKJ7 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smu1Q3UKJ7 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Smu1Q3UKJ7 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smu1Q3UKJ7 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Smu1Q3UKJ7 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smu1Q3UKJ7 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smu1Q3UKJ7 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Smu1Q3UKJ7 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Smu1Q3UKJ7 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smu1Q3UKJ7 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Smu1Q3UKJ7 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smu1Q3UKJ7 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Smu1Q3UKJ7 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smu1Q3UKJ7 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smu1Q3UKJ7 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smu1Q3UKJ7 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smu1Q3UKJ7 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smu1Q3UKJ7 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smu1Q3UKJ7 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smu1Q3UKJ7 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smu1Q3UKJ7 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Smu1Q3UKJ7 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smu1Q3UKJ7 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Smu1Q3UKJ7 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smu1Q3UKJ7 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Smu1Q3UKJ7 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smu1Q3UKJ7 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smu1Q3UKJ7 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Smu1Q3UKJ7 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smu1Q3UKJ7 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smu1Q3UKJ7 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smu1Q3UKJ7 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smu1Q3UKJ7 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smu1Q3UKJ7 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smu1Q3UKJ7 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smu1Q3UKJ7 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smu1Q3UKJ7 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smu1Q3UKJ7 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smu1Q3UKJ7 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smu1Q3UKJ7 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smu1Q3UKJ7 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smu1Q3UKJ7 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smu1Q3UKJ7 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smu1Q3UKJ7 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smu1Q3UKJ7 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smu1Q3UKJ7 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smu1Q3UKJ7 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smu1Q3UKJ7 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smu1Q3UKJ7 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms