Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJU9

Rmdn3, Regulator of microtubule dynamics protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rmdn3Q3UJU9 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rmdn3Q3UJU9 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rmdn3Q3UJU9 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rmdn3Q3UJU9 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rmdn3Q3UJU9 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rmdn3Q3UJU9 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rmdn3Q3UJU9 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rmdn3Q3UJU9 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rmdn3Q3UJU9 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rmdn3Q3UJU9 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rmdn3Q3UJU9 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rmdn3Q3UJU9 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rmdn3Q3UJU9 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rmdn3Q3UJU9 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rmdn3Q3UJU9 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rmdn3Q3UJU9 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rmdn3Q3UJU9 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rmdn3Q3UJU9 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rmdn3Q3UJU9 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rmdn3Q3UJU9 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rmdn3Q3UJU9 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rmdn3Q3UJU9 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rmdn3Q3UJU9 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rmdn3Q3UJU9 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rmdn3Q3UJU9 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rmdn3Q3UJU9 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rmdn3Q3UJU9 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rmdn3Q3UJU9 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rmdn3Q3UJU9 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rmdn3Q3UJU9 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rmdn3Q3UJU9 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rmdn3Q3UJU9 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rmdn3Q3UJU9 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rmdn3Q3UJU9 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rmdn3Q3UJU9 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rmdn3Q3UJU9 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rmdn3Q3UJU9 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rmdn3Q3UJU9 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rmdn3Q3UJU9 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rmdn3Q3UJU9 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rmdn3Q3UJU9 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rmdn3Q3UJU9 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rmdn3Q3UJU9 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rmdn3Q3UJU9 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rmdn3Q3UJU9 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rmdn3Q3UJU9 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rmdn3Q3UJU9 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rmdn3Q3UJU9 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rmdn3Q3UJU9 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rmdn3Q3UJU9 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms