Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

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Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nkx6-3Q3UHX8 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nkx6-3Q3UHX8 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nkx6-3Q3UHX8 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nkx6-3Q3UHX8 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nkx6-3Q3UHX8 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nkx6-3Q3UHX8 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Nkx6-3Q3UHX8 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Nkx6-3Q3UHX8 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Nkx6-3Q3UHX8 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nkx6-3Q3UHX8 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Nkx6-3Q3UHX8 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Nkx6-3Q3UHX8 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nkx6-3Q3UHX8 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nkx6-3Q3UHX8 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nkx6-3Q3UHX8 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Nkx6-3Q3UHX8 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nkx6-3Q3UHX8 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Nkx6-3Q3UHX8 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nkx6-3Q3UHX8 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nkx6-3Q3UHX8 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nkx6-3Q3UHX8 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nkx6-3Q3UHX8 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nkx6-3Q3UHX8 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nkx6-3Q3UHX8 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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