Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD01

Atxn7l3b, Ataxin-7-like protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn7l3bQ3UD01 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms