Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc174Q3U155 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc174Q3U155 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc174Q3U155 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc174Q3U155 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc174Q3U155 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc174Q3U155 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc174Q3U155 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc174Q3U155 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc174Q3U155 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc174Q3U155 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc174Q3U155 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc174Q3U155 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc174Q3U155 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms