Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 333.8 ms