Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYU2

Atp13a5, Probable cation-transporting ATPase 13A5, mousemouse

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a5Q3TYU2 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp13a5Q3TYU2 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp13a5Q3TYU2 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp13a5Q3TYU2 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp13a5Q3TYU2 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp13a5Q3TYU2 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp13a5Q3TYU2 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp13a5Q3TYU2 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp13a5Q3TYU2 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp13a5Q3TYU2 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp13a5Q3TYU2 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp13a5Q3TYU2 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp13a5Q3TYU2 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp13a5Q3TYU2 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp13a5Q3TYU2 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp13a5Q3TYU2 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp13a5Q3TYU2 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp13a5Q3TYU2 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp13a5Q3TYU2 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp13a5Q3TYU2 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp13a5Q3TYU2 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp13a5Q3TYU2 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Atp13a5Q3TYU2 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms