Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Srsf6Q3TWW8 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Srsf6Q3TWW8 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Srsf6Q3TWW8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Srsf6Q3TWW8 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Srsf6Q3TWW8 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Srsf6Q3TWW8 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Srsf6Q3TWW8 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Srsf6Q3TWW8 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Srsf6Q3TWW8 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Srsf6Q3TWW8 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Srsf6Q3TWW8 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Srsf6Q3TWW8 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Srsf6Q3TWW8 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Srsf6Q3TWW8 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Srsf6Q3TWW8 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Srsf6Q3TWW8 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Srsf6Q3TWW8 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Srsf6Q3TWW8 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Srsf6Q3TWW8 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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