Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTD8

Gm21440, Predicted gene, 20737, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21440Q3TTD8 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm21440Q3TTD8 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm21440Q3TTD8 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm21440Q3TTD8 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm21440Q3TTD8 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm21440Q3TTD8 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm21440Q3TTD8 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm21440Q3TTD8 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm21440Q3TTD8 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm21440Q3TTD8 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm21440Q3TTD8 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm21440Q3TTD8 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm21440Q3TTD8 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm21440Q3TTD8 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm21440Q3TTD8 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm21440Q3TTD8 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm21440Q3TTD8 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm21440Q3TTD8 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm21440Q3TTD8 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm21440Q3TTD8 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm21440Q3TTD8 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm21440Q3TTD8 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm21440Q3TTD8 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm21440Q3TTD8 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm21440Q3TTD8 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm21440Q3TTD8 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm21440Q3TTD8 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm21440Q3TTD8 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm21440Q3TTD8 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm21440Q3TTD8 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm21440Q3TTD8 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm21440Q3TTD8 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm21440Q3TTD8 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm21440Q3TTD8 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm21440Q3TTD8 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm21440Q3TTD8 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm21440Q3TTD8 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm21440Q3TTD8 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm21440Q3TTD8 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm21440Q3TTD8 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm21440Q3TTD8 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm21440Q3TTD8 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21440Q3TTD8 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21440Q3TTD8 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21440Q3TTD8 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21440Q3TTD8 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21440Q3TTD8 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21440Q3TTD8 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21440Q3TTD8 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21440Q3TTD8 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21440Q3TTD8 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21440Q3TTD8 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21440Q3TTD8 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21440Q3TTD8 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21440Q3TTD8 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21440Q3TTD8 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21440Q3TTD8 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21440Q3TTD8 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21440Q3TTD8 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21440Q3TTD8 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21440Q3TTD8 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21440Q3TTD8 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21440Q3TTD8 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21440Q3TTD8 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21440Q3TTD8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21440Q3TTD8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21440Q3TTD8 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21440Q3TTD8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21440Q3TTD8 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21440Q3TTD8 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21440Q3TTD8 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21440Q3TTD8 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21440Q3TTD8 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21440Q3TTD8 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21440Q3TTD8 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21440Q3TTD8 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21440Q3TTD8 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21440Q3TTD8 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21440Q3TTD8 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21440Q3TTD8 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21440Q3TTD8 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21440Q3TTD8 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21440Q3TTD8 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21440Q3TTD8 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21440Q3TTD8 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21440Q3TTD8 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21440Q3TTD8 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21440Q3TTD8 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21440Q3TTD8 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21440Q3TTD8 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21440Q3TTD8 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21440Q3TTD8 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21440Q3TTD8 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21440Q3TTD8 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21440Q3TTD8 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21440Q3TTD8 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21440Q3TTD8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21440Q3TTD8 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21440Q3TTD8 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21440Q3TTD8 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms