Protein–RNA interactions for Protein: Q3TR08

Fndc4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc4Q3TR08 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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