Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp39Q3TIX9 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms