Protein–RNA interactions for Protein: Q2V6D6

Gbp8, Guanylate-binding protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp8Q2V6D6 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Gbp8Q2V6D6 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Gbp8Q2V6D6 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Gbp8Q2V6D6 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gbp8Q2V6D6 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gbp8Q2V6D6 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gbp8Q2V6D6 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Gbp8Q2V6D6 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gbp8Q2V6D6 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Gbp8Q2V6D6 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gbp8Q2V6D6 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gbp8Q2V6D6 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gbp8Q2V6D6 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbp8Q2V6D6 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbp8Q2V6D6 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbp8Q2V6D6 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbp8Q2V6D6 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbp8Q2V6D6 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbp8Q2V6D6 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbp8Q2V6D6 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbp8Q2V6D6 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbp8Q2V6D6 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbp8Q2V6D6 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbp8Q2V6D6 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Gbp8Q2V6D6 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbp8Q2V6D6 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Gbp8Q2V6D6 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbp8Q2V6D6 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbp8Q2V6D6 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Gbp8Q2V6D6 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Gbp8Q2V6D6 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp8Q2V6D6 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp8Q2V6D6 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp8Q2V6D6 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp8Q2V6D6 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Gbp8Q2V6D6 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp8Q2V6D6 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp8Q2V6D6 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp8Q2V6D6 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gbp8Q2V6D6 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Gbp8Q2V6D6 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp8Q2V6D6 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp8Q2V6D6 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp8Q2V6D6 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp8Q2V6D6 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp8Q2V6D6 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp8Q2V6D6 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbp8Q2V6D6 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbp8Q2V6D6 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbp8Q2V6D6 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbp8Q2V6D6 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Gbp8Q2V6D6 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbp8Q2V6D6 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbp8Q2V6D6 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbp8Q2V6D6 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbp8Q2V6D6 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbp8Q2V6D6 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbp8Q2V6D6 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbp8Q2V6D6 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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