Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Shroom4Q1W617 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
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Shroom4Q1W617 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Shroom4Q1W617 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Shroom4Q1W617 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Shroom4Q1W617 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Shroom4Q1W617 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Shroom4Q1W617 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Shroom4Q1W617 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Shroom4Q1W617 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Shroom4Q1W617 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Shroom4Q1W617 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Shroom4Q1W617 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Shroom4Q1W617 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Shroom4Q1W617 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Shroom4Q1W617 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
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Shroom4Q1W617 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms