Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms