Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttc39dQ0VF76 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttc39dQ0VF76 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttc39dQ0VF76 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttc39dQ0VF76 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttc39dQ0VF76 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttc39dQ0VF76 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttc39dQ0VF76 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttc39dQ0VF76 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttc39dQ0VF76 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttc39dQ0VF76 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttc39dQ0VF76 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttc39dQ0VF76 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttc39dQ0VF76 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttc39dQ0VF76 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttc39dQ0VF76 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttc39dQ0VF76 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttc39dQ0VF76 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttc39dQ0VF76 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttc39dQ0VF76 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttc39dQ0VF76 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc39dQ0VF76 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc39dQ0VF76 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc39dQ0VF76 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc39dQ0VF76 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc39dQ0VF76 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc39dQ0VF76 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc39dQ0VF76 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc39dQ0VF76 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc39dQ0VF76 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc39dQ0VF76 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc39dQ0VF76 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc39dQ0VF76 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc39dQ0VF76 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc39dQ0VF76 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc39dQ0VF76 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc39dQ0VF76 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc39dQ0VF76 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc39dQ0VF76 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc39dQ0VF76 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc39dQ0VF76 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc39dQ0VF76 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc39dQ0VF76 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc39dQ0VF76 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ttc39dQ0VF76 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ttc39dQ0VF76 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ttc39dQ0VF76 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ttc39dQ0VF76 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms