Protein–RNA interactions for Protein: Q08AU9

UPF0450 protein C17orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q08AU9 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q08AU9 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q08AU9 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q08AU9 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q08AU9 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q08AU9 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q08AU9 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q08AU9 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q08AU9 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q08AU9 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q08AU9 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q08AU9 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q08AU9 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q08AU9 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q08AU9 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q08AU9 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q08AU9 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q08AU9 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q08AU9 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q08AU9 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q08AU9 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q08AU9 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Q08AU9 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Q08AU9 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Q08AU9 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Q08AU9 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Q08AU9 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Q08AU9 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Q08AU9 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Q08AU9 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Q08AU9 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q08AU9 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q08AU9 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Q08AU9 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q08AU9 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q08AU9 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q08AU9 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q08AU9 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q08AU9 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q08AU9 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q08AU9 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q08AU9 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q08AU9 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q08AU9 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q08AU9 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Q08AU9 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q08AU9 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q08AU9 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q08AU9 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q08AU9 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q08AU9 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q08AU9 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q08AU9 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q08AU9 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q08AU9 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q08AU9 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q08AU9 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q08AU9 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q08AU9 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q08AU9 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q08AU9 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q08AU9 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q08AU9 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q08AU9 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q08AU9 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Q08AU9 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q08AU9 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Q08AU9 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q08AU9 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q08AU9 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q08AU9 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q08AU9 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q08AU9 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q08AU9 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q08AU9 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q08AU9 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q08AU9 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Q08AU9 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q08AU9 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Q08AU9 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q08AU9 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q08AU9 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q08AU9 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q08AU9 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q08AU9 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q08AU9 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q08AU9 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q08AU9 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q08AU9 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q08AU9 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q08AU9 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q08AU9 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q08AU9 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q08AU9 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q08AU9 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q08AU9 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q08AU9 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q08AU9 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q08AU9 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q08AU9 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms