Protein–RNA interactions for Protein: Q07802

Ebf1, Transcription factor COE1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebf1Q07802 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms