Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cdx4Q07424 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cdx4Q07424 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cdx4Q07424 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cdx4Q07424 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cdx4Q07424 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cdx4Q07424 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms