Protein–RNA interactions for Protein: Q07105

Gdf9, Growth/differentiation factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf9Q07105 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gdf9Q07105 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gdf9Q07105 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gdf9Q07105 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gdf9Q07105 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gdf9Q07105 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gdf9Q07105 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gdf9Q07105 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gdf9Q07105 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gdf9Q07105 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gdf9Q07105 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gdf9Q07105 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gdf9Q07105 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gdf9Q07105 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gdf9Q07105 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gdf9Q07105 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gdf9Q07105 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gdf9Q07105 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gdf9Q07105 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gdf9Q07105 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gdf9Q07105 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gdf9Q07105 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gdf9Q07105 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gdf9Q07105 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gdf9Q07105 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gdf9Q07105 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gdf9Q07105 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gdf9Q07105 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gdf9Q07105 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gdf9Q07105 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gdf9Q07105 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gdf9Q07105 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gdf9Q07105 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gdf9Q07105 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gdf9Q07105 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gdf9Q07105 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gdf9Q07105 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gdf9Q07105 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gdf9Q07105 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gdf9Q07105 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gdf9Q07105 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gdf9Q07105 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gdf9Q07105 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gdf9Q07105 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gdf9Q07105 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gdf9Q07105 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gdf9Q07105 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gdf9Q07105 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gdf9Q07105 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gdf9Q07105 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gdf9Q07105 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gdf9Q07105 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gdf9Q07105 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gdf9Q07105 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gdf9Q07105 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gdf9Q07105 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gdf9Q07105 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gdf9Q07105 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gdf9Q07105 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gdf9Q07105 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gdf9Q07105 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gdf9Q07105 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gdf9Q07105 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gdf9Q07105 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gdf9Q07105 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gdf9Q07105 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms