Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gdf3Q07104 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gdf3Q07104 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gdf3Q07104 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gdf3Q07104 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gdf3Q07104 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gdf3Q07104 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gdf3Q07104 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gdf3Q07104 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gdf3Q07104 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gdf3Q07104 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gdf3Q07104 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gdf3Q07104 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gdf3Q07104 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gdf3Q07104 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gdf3Q07104 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gdf3Q07104 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gdf3Q07104 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gdf3Q07104 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gdf3Q07104 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gdf3Q07104 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gdf3Q07104 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gdf3Q07104 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gdf3Q07104 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gdf3Q07104 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gdf3Q07104 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gdf3Q07104 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gdf3Q07104 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gdf3Q07104 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gdf3Q07104 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gdf3Q07104 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gdf3Q07104 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gdf3Q07104 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gdf3Q07104 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gdf3Q07104 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gdf3Q07104 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gdf3Q07104 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gdf3Q07104 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gdf3Q07104 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gdf3Q07104 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gdf3Q07104 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gdf3Q07104 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gdf3Q07104 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Gdf3Q07104 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gdf3Q07104 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gdf3Q07104 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gdf3Q07104 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gdf3Q07104 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gdf3Q07104 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gdf3Q07104 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gdf3Q07104 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gdf3Q07104 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gdf3Q07104 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gdf3Q07104 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gdf3Q07104 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gdf3Q07104 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gdf3Q07104 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gdf3Q07104 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gdf3Q07104 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gdf3Q07104 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gdf3Q07104 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Gdf3Q07104 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Gdf3Q07104 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Gdf3Q07104 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gdf3Q07104 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Gdf3Q07104 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gdf3Q07104 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gdf3Q07104 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gdf3Q07104 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gdf3Q07104 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gdf3Q07104 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Gdf3Q07104 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gdf3Q07104 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gdf3Q07104 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gdf3Q07104 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gdf3Q07104 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gdf3Q07104 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gdf3Q07104 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gdf3Q07104 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gdf3Q07104 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Gdf3Q07104 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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