Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Siah1bQ06985 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Siah1bQ06985 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Siah1bQ06985 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Siah1bQ06985 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Siah1bQ06985 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Siah1bQ06985 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Siah1bQ06985 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Siah1bQ06985 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Siah1bQ06985 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Siah1bQ06985 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms