Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms