Protein–RNA interactions for Protein: Q05AH6

SPINDOC, SPIN1-docking protein, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINDOCQ05AH6 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms