Protein–RNA interactions for Protein: Q04207

Rela, Transcription factor p65, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelaQ04207 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RelaQ04207 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RelaQ04207 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RelaQ04207 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms