Protein–RNA interactions for Protein: Q03958

Pfdn6, Prefoldin subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn6Q03958 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pfdn6Q03958 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms