Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms