Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms