Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nhlh1Q02576 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms