Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms