Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms