Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms