Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EgfrQ01279 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EgfrQ01279 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EgfrQ01279 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EgfrQ01279 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EgfrQ01279 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EgfrQ01279 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EgfrQ01279 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EgfrQ01279 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EgfrQ01279 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EgfrQ01279 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EgfrQ01279 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EgfrQ01279 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EgfrQ01279 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
EgfrQ01279 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
EgfrQ01279 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms