Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Grin2bQ01097 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Grin2bQ01097 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Grin2bQ01097 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Grin2bQ01097 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Grin2bQ01097 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Grin2bQ01097 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Grin2bQ01097 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Grin2bQ01097 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Grin2bQ01097 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Grin2bQ01097 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Grin2bQ01097 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Grin2bQ01097 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Grin2bQ01097 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Grin2bQ01097 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Grin2bQ01097 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Grin2bQ01097 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Grin2bQ01097 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Grin2bQ01097 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Grin2bQ01097 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Grin2bQ01097 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Grin2bQ01097 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Grin2bQ01097 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Grin2bQ01097 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Grin2bQ01097 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Grin2bQ01097 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Grin2bQ01097 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Grin2bQ01097 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Grin2bQ01097 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Grin2bQ01097 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Grin2bQ01097 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Grin2bQ01097 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Grin2bQ01097 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Grin2bQ01097 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Grin2bQ01097 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Grin2bQ01097 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Grin2bQ01097 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Grin2bQ01097 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Grin2bQ01097 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Grin2bQ01097 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Grin2bQ01097 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Grin2bQ01097 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Grin2bQ01097 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Grin2bQ01097 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Grin2bQ01097 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Grin2bQ01097 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Grin2bQ01097 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Grin2bQ01097 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Grin2bQ01097 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Grin2bQ01097 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Grin2bQ01097 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Grin2bQ01097 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Grin2bQ01097 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Grin2bQ01097 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Grin2bQ01097 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Grin2bQ01097 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Grin2bQ01097 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Grin2bQ01097 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Grin2bQ01097 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Grin2bQ01097 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Grin2bQ01097 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Grin2bQ01097 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Grin2bQ01097 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Grin2bQ01097 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Grin2bQ01097 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Grin2bQ01097 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Grin2bQ01097 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Grin2bQ01097 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Grin2bQ01097 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Grin2bQ01097 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Grin2bQ01097 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Grin2bQ01097 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Grin2bQ01097 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Grin2bQ01097 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Grin2bQ01097 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Grin2bQ01097 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Grin2bQ01097 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Grin2bQ01097 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Grin2bQ01097 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Grin2bQ01097 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Grin2bQ01097 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Grin2bQ01097 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Grin2bQ01097 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Grin2bQ01097 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Grin2bQ01097 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Grin2bQ01097 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Grin2bQ01097 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Grin2bQ01097 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Grin2bQ01097 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Grin2bQ01097 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Grin2bQ01097 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Grin2bQ01097 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Grin2bQ01097 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Grin2bQ01097 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Grin2bQ01097 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Grin2bQ01097 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Grin2bQ01097 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Grin2bQ01097 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Grin2bQ01097 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Grin2bQ01097 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms