Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms